Recherche de marqueurs ADN du sexe chez les Dendrobatidae

Les dendrobates sont de petits amphibiens néotropicaux qui, à l'instar de nombreuses espèces d'oiseaux, n'ont pas de dimorphisme sexuel évident.

Le premier prélèvement ADN d'une dendrobate de notre élevage date du 6 novembre 2021. Depuis, des dizaines ont suivit.
Ces petites grenouilles amazoniennes ont été patiemment sexés par l'observation de leur comportement.

Une liste d'échantillons de sexe connu a été progressivement complété: c'est le point de départ d'une passionnante recherche de marqueurs sexuels au cœur du génome.
Après les années d'échantillonnage, quelques mois de travail ont révélés deux marqueurs candidats (en janvier et février 2026) pour une première espèce, la Ranitomeya vanzolinii:

Le dimanche 8 mars 2026, le premier sexage génétique de dendrobate de l'histoire à été réalisée (avec les marqueurs candidats bruts):

Les nominées:

*Malabar restera la première: c'est un têtard resté bloqué sous forme larvaire toute sa vie (2 ans et 5 mois à recevoir les meilleurs soins). Il est décédé en 2022. Un peu de son ADN avait été conservé à l'époque "au cas où".

*Aspen et Arsène, deux petites grenouillettes en pleine forme, sortie de l'eau le 20/02/2026 pour la première et 07/03/2026 pour la seconde.

Toutes les trois… des femelles!

Les recherches se poursuivent pour mieux caractériser ces deux marqueurs ("049" et "108"). Le séquençage à été effectué:

Update 31 05 2026:

Pour les deux marqueurs candidats, il y a des différences de séquences de type indel (insertion/délétion de quelques nucléotides) entre mâles et femelles. Ce sont les bandes observables sur les électrophorèses en illustration. 

Les femelles possèdent une seule version de séquence ADN. Les mâles possèdent deux versions de séquences ADN. Cela suggèrent un déterminisme sexuel de type XY chez la Ranitomeya vanzolinii. Un blast dans les bases de données fait ressortir une homologie très forte avec des séquences du chromosome 3 chez Ranitomeya variabilis et Ranitomeya imitator. Des essais avec les mêmes marqueurs sur Ranitomeya imitator n'ont malheureusement rien donné pour le moment. Il est possible (probable) que les marqueurs découverts soit spécifiques à Ranitomeya vanzolinii

Le séquençage a permis d'affiner le protocole de PCR en réalisant des amorces spécifiques. Etonnement, certains mâles montrent une troisième bande (c'est un hétéroduplex).

Julien G.